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發酵生產過程中發酵罐上存在的漏洞也是染菌的一個重要因素，在發酵罐結構中，構成發酵染菌的因素有以下幾方面：發酵罐結構不合理，發酵罐安裝不合理，發酵罐本身的泄露、si角和發酵罐管理上的漏洞。由發酵罐廠家介紹一下發酵罐發酵方法設計不合理也容易染菌。
發酵罐的漏洞可能由化學腐蝕、電化學腐蝕、磨蝕以及操作不當引起發酵罐穿孔。發酵的系統發酵罐不合理也會染菌，例如蒸汽系統、無菌空氣系統、物料消Du系統、冷水系統等。蒸汽的溫度高低、壓力大小、蒸汽中含冷凝水量會影響蒸汽的質量，由于濕飽和蒸汽中冷凝水含量大，蒸汽溫度低、壓力波動大，可能造成滅菌溫度時間達不到雜菌的致si時間和致si溫度而造成發酵染菌。
蒸汽管路過長、支路過多、循環使用或者連接未消Du發酵罐都會造成染菌。空氣系統造成雜菌的因素主要有空氣中帶油帶水、總空氣系統的安裝不當以及沒有定期檢查。物料消Du系統引起的雜菌主要是發酵罐的si角積累雜菌或者是沒有定期檢查。
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